微生物污染－新冠状病毒
[ 发表日期：2020-04-14 ]
微生物污染－新冠状病毒
一、 病原学
（一）概述
新冠状病毒属于套式病毒目、新冠状病毒科、新冠状病毒属，是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒，是自然界广泛存在的一大类病毒。病毒基因组5′端具有甲基化的帽状结构，3′端具有poly(A)尾，基因组全长约27-32kb，是目前已知RNA病毒中基因组最大的病毒[1]。新冠状病毒仅感染脊椎动物，与人和动物的多种疾病有关，可引起人和动物呼吸道、消化道和神经系统疾病[2]。
（二）分类
根据系统发育树，新冠状病毒可分为四个属：α、β、γ、δ，其中β属新冠状病毒又可分为四个独立的亚群A、B、C和D群[3]。
1.可感染人的新冠状病毒。迄今为止，除本次在武汉引起病毒性肺炎暴发疫情的新的新冠状病毒外，共发现6种可感染人类的新冠状病毒（HCoV-229E、HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU1 和MERS-CoV）。HCoV-229E 和HCoV-NL63属于α属新冠状病毒，HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-HKU1 和MERS-CoV均为β属新冠状病毒，其中，HCoV-OC43 和HCoV-HKU1 属于A亚群，SARS-CoV 属于B亚群，MERS-CoV属于C亚群（见图1）。
2.动物新冠状病毒。包括哺乳动物新冠状病毒和禽新冠状病毒。哺乳动物新冠状病毒主要为α、β属新冠状病毒，可感染包括猪、犬、猫、鼠、牛、马等多种动物。禽新冠状病毒主要来源于γ、δ属新冠状病毒，可引起多种禽鸟类如鸡、火鸡、麻雀、鸭、鹅、鸽子等发病[4]。
（三）理化特性
人新冠状病毒对热较为敏感，病毒在4℃合适维持液中为中等稳定，-60℃可保存数年，但随着温度的升高，病毒的抵抗力下降，如HCoV-229E于56℃ 10分钟或者37℃数小时即可使丧失感染性， SARS-CoV于37℃可存活4天，56℃加热90分钟、75℃加热30分钟能够灭活病毒。
人新冠状病毒不耐酸不耐碱，病毒复制的最适宜PH值为7.2。
人新冠状病毒对有机溶剂和消毒剂敏感，75%酒精、乙醚、氯仿、甲醛、含氯消毒剂、过氧乙酸和紫外线均可灭活病毒[2]。
人新冠状病毒中SARS-CoV于室温24℃条件下在尿液里至少可存活10天，在腹泻病人的痰液和粪便里能存活5天以上，在血液中可存活约15天，在塑料、玻璃、马赛克、金属、布料、复印纸等多种物体表面均可存活2-3天[5]。
参考文献
[1] Weiss S.R, S Navas-Martin. Coronavirus pathogenesis and the emerging pathogen severe acute respiratory syndrome coronavirus[J]. Microbiol Mol Biol Rev, 2005. 69(4): 635-64.
[2]刘克洲.人类病毒性疾病[M].北京:人民卫生出版社,2010:643-665.
[3]http://ictvonline.org/proposals/2008.085-122 V.v4.Coronaviridae.pdf
[4]杨扬,谭文杰.新冠状病毒载体研究进展[J].病毒学报,2012.28(03):297-302.
[5] （传染性非典型肺炎（SARS）诊疗方案（2004版））
二、临床表现
常见的人新冠状病毒（包括229E、NL63、OC43和HKU1型），通常会引起轻度或中度的上呼吸道疾病，如感冒。症状主要包括流鼻涕、头痛、咳嗽、咽喉痛、发热等，有时会引起肺炎或支气管炎等下呼吸道疾病，心肺疾病患者、免疫力低下人群、婴儿和老年人中较为常见。
MERS-CoV和SARS-CoV常引起较为严重症状。MERS症状通常包括发热、咳嗽和呼吸急促，甚至发展为肺炎，病死率约为34.4%。SARS症状通常包括发热、畏寒和身体疼痛，甚至发展为肺炎，病死率约为9.6%。
三、流行病学
人新冠状病毒可对人造成普通感冒，严重急性呼吸综合征（SARS）和中东呼吸综合征（MERS）,在流行病学特征上存在一定差异。
在全球，10%~30%的上呼吸道感染由HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63和HCoV-HKU1四类新冠状病毒引起，在造成普通感冒的病因中占第二位[1]，仅次于鼻病毒。感染呈现季节性流行，每年春季和冬季为疾病高发期[2]。潜伏期2-5天，人群普遍易感。主要通过人与人接触传播[3]。
SARS由人感染SARS-CoV引起，首先出现在我国广东省部分地区，之后波及我国24个省、自治区、直辖市和全球其他28个国家和地区。2002年11月至2003年7月全球首次SARS流行中，全球共报告临床诊断病例8096例，死亡774例，病死率9.6%。SARS的潜伏期通常限于2周之内，一般约2～10天。人群普遍易感。SARS病人为最主要的传染源，症状明显的病人传染性较强，潜伏期或治愈的病人不具备传染性[4]。
MERS是一种由MERS-CoV引起的病毒性呼吸道疾病，于2012年在沙特阿拉伯首次得到确认。自2012年起，MERS在全球共波及中东、亚洲、欧洲等27个国家和地区，80%的病例来自沙特阿拉伯，病死率约35%。潜伏期最长为14天，人群普遍易感。单峰骆驼是MERS-CoV的一大宿主，且为人间病例的主要传染来源，人与人之间传播能力有限[5]。自2004年以来，全球未报告过SARS人间病例。
参考文献
[1]刘克洲.人类病毒性疾病[M].北京:人民卫生出版社,2010:643-665.
[2] YuDong Yin. MERS, SARS and other coronaviruses as causes of pneumonia[J]. Respirology, 2018,23:130–137.
[3] Shuo Su. Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses[J]. Trends in Microbiology, 2016, 24(6):490-502.
[4]《SARS诊疗方案（2004版）》
[5] 世界卫生组织网站. https://www.who.int/zh/news-room/fact-sheets/detail/middle-east-respiratory-syndrome-coronavirus-(mers-cov)
四、实验室检测方法
已知的6种可感染人类的新冠状病毒中，中东呼吸综合征新冠状病毒（MERS-CoV）和严重急性呼吸综合征新冠状病毒（SARS-CoV）所致疾病的严重程度以及社会影响远远超过其它新冠状病毒，实验室检测方法相对较为成熟。
（一）中东呼吸综合征新冠状病毒（MERS-CoV）
病原学检查主要包括病毒分离、病毒核酸检测。病毒分离为实验室检测的“金标准”。病毒核酸检测可以用于早期诊断。检测时应及时留取多种标本（咽拭子、鼻拭子、鼻咽或气管抽取物、痰或肺组织，以及血液和粪便）进行检测，其中以下呼吸道标本阳性检出率更高。
1.病毒核酸检测（PCR）。以RT-PCR（最好采用real-time RT-PCR）法检测呼吸道标本中的MERS-CoV核酸。
2.病毒分离培养。可从呼吸道标本中分离出MERS-CoV,但一般在细胞中分离培养较为困难。
（二）严重急性呼吸综合征新冠状病毒（SARS-CoV）
1.SARS-CoV RNA检测：SARS-CoV RNA阳性判断标准为PCR检测结果符合下列三项之一者可判断为阳性。
（1）至少需要两个不同部位的临床标本检测阳性（例如鼻咽分泌物和粪便）。
（2）收集至少间隔2天的同一种临床标本送检检测阳性（例如2份或多份鼻咽分泌物）。
（3）在每一个特定检测中对原临床标本使用两种不同的方法，或从原标本新提取RNA开始重复PCR检测阳性。
PCR检测结果的确认：①使用原始标本重复PCR试验；②在第二个实验室检测同一份标本。
2.SARS-CoV特异性抗原N蛋白检测：定性检测血清或血浆标本中SARS-CoV核衣壳(N)抗原，用于SARS-CoV感染的早期辅助诊断。
3.SARS-CoV特异性抗体检测：特异性抗体检测诊断SARS标准为符合以下两者之一即可诊断为SARS。
（1）平行检测急性期血清抗体和恢复期血清抗体发现抗体阳转。
（2）平行检测急性期血清抗体和恢复期血清抗体发现抗体滴度升高≥4倍。